Célibataire et séducteur, Nick Halloway
(Chevy Chase) fait la connaissance d'Alice Monroe
(Daryl Hannah) lors d'une soirée entre amis. Le lendemain, s'endormant durant une conférence à Magnascopia Laboratories, il devient invisible suite à un accident qu'il a provoqué. David Jenkins
(Sam Neill), agent de la CIA intervenu pour observer l'étrange phénomène du bâtiment partiellement transparent, voit en lui l'espion idéal car inatteignable. Contre l'avis de son collègue Warren Singleton
(Stephen Tobolowsky), il cache cette information à ses supérieurs. Mais Nick fuit. Il n'ose manger de peur de se trahir, et se réfugie dans son club privé désert. Il tente de contacter le professeur Wachs
(Jim Norton), responsable des recherches sur le magnétisme à l'origine de son invisibilité, mais est pris en chasse par les hommes de Jenkins. Nick quitte Washington pour la maison secondaire vide de son ami George Talbot
(Michael McKean). Ignorant la situation, celui-ci débarque avec Alice et des amis. Nick révèle son état à Alice, qui reste avec lui pour l'aider. Lorsque Jenkins retrouve leurs traces, ils partent dans l'espoir de gagner le Mexique. L'homme invisible libère sa bien-aimée des griffes de Jenkins, qu'il attire dans le vide... Le couple ira vivre en Suisse, où le climat permet de garder le passe-montagne toute l'année !...
